O que é um contig?
Um contig, abreviado para contíguo, refere -se a um segmento de ácido desoxirribonucleico (DNA) ou ao produto de segmentos sobrepostos que formam uma sequência de DNA contínua, extensa e ininterrupta. Ao estudar mapas desses segmentos, é possível descobrir a ordem dos segmentos compreendendo várias seqüências, e os contigs podem ser adicionados, removidos ou reorganizados para formar novas seqüências. O mapeamento e as bibliotecas de contig de DNA permitem que os pesquisadores identifiquem alinhamentos que possam causar doenças, fornecer uma melhor compreensão de como as células reagem sob certas condições e permitem a capacidade de clonar características favoráveis nos organismos vivos.
Contigs genômicos são conectados um outro pela sobreposição de conjuntos marcados com sequência correspondente ou por tags de sequência expressas correspondentes. Ao entender este processo de bloco de construção usado pelas bases dos segmentos de DNA, os contigs podem replicar ou clonados em sequências desejáveis, adicionando ou eliminando segmentos menos favoráveis. Os pesquisadores veem essas seqüênciascomo mapas em programas de DNA altamente detalhados e computadorizados. O programa fornece uma quebra visual das bases usadas para construir os segmentos e os segmentos usados para construir sequências específicas. Usando diferentes esquemas de cores, vários programas Contig exibem essas informações como seqüências baixas, médias e de alta qualidade.
O mapeamento de contig freqüentemente lança luz sobre as causas de distúrbios genéticos. A síndrome de Williams, por exemplo, produz sintomas de vários sistemas em crianças, incluindo problemas cardiovasculares, níveis elevados de cálcio no sangue e falha em prosperar. Os pesquisadores descobriram deleções de banda que afetam certos genes, que podem ser causados por sobreposição inadequada de contigs. Outro distúrbio genético da infância, a síndrome de Cri-Du-Chat, também produz vários sintomas, cada um dos quais os cientistas acreditam se correlacionar com deleções e posicionamento anormal.
Pesquisadores também analSequências de Contig Yze em espécies vegetais. Cada planta contém sequenciamento exclusivo dessa planta e, obtendo mapas de espécies de plantas individuais, os cientistas descobrem características semelhantes e variadas que podem contribuir para a saúde ou deterioração de um tipo de planta específico. Ao analisar segmentos e seqüências de contig em organismos portadores de doenças, os médicos podem determinar características que podem ser usadas no desenvolvimento do tratamento. O mapeamento fornece uma visão visual sobre possíveis manipulações genéticas por meio de deleções de sequência ou clonagem.
Os cientistas podem cultivar amostras de DNA clonadas no cromossomo artificial bacteriano, cromossomo artificial de levedura, ou em P1 ou meios cromossômicos artificiais de P1. Esses cromossomos contêm de 50 a centenas de milhares de bases, que compilam segmentos de contig. Após um período de colonização, as amostras são extraídas usando uma seringa e colocadas em gel de sequenciamento de DNA, que sofre eletroforese e seca. Uma autoradiografia lê oamostra e impressões digitais as seqüências. Os pesquisadores então examinam a impressão digital em um arquivo de imagem, que mais tarde pode ser carregado em um programa Contig.