Vad är en kontig?
En contig, kort för sammanhängande, hänvisar till antingen ett deoxyribonukleinsyra (DNA) -segment eller produkten av överlappande segment som bildar en kontinuerlig, omfattande, oavbruten DNA -sekvens. Genom att studera kartor över dessa segment är det möjligt att upptäcka ordningen på segment som består av olika sekvenser, och contigs kan läggas till, tas bort eller omorganiseras för att bilda nya sekvenser. DNA Contig -mappning och bibliotek gör det möjligt för forskare att identifiera justeringar som kan orsaka sjukdom, ge en bättre förståelse för hur celler reagerar under vissa förhållanden och möjliggör förmågan att klona gynnsamma egenskaper i levande organismer.
Genomiska konturer är anslutna till varandra genom överlappningen av matchande sekvenstaggade uppsättningar eller genom att matcha uttryckta sekvenstaggar. Genom att förstå denna byggblockprocess som används av baserna i DNA -segment kan contigs replikeras eller klonas i önskvärda sekvenser, lägga till eller eliminera mindre gynnsamma segment. Forskare ser dessa sekvensersom kartor på mycket detaljerade, datoriserade DNA -program. Programmet ger en visuell uppdelning av baserna som används för att konstruera segmenten och de segment som används för att bygga vissa sekvenser. Med hjälp av olika färgscheman visar olika contig -program denna information som låga, medelstora och högkvalitativa sekvenser.
contig mapping belyser ofta lätt på orsakerna till genetiska störningar. Williams syndrom producerar till exempel symtom med flera system hos barn, inklusive hjärt-kärlproblem, förhöjda kalciumnivåer i blodet och misslyckande med att trivas. Forskare upptäckte att band -borttagning som påverkar vissa gener, vilket kan orsakas av olämplig överlappning av kontig. En annan genetisk barndomsjukdom, Cri-Du-Chat-syndrom, producerar också flera symtom, som var och en forskare tror att korrelerar med borttagningar och onormal positionering.
forskare också analYze contig -sekvenser i växtarter. Varje växt innehåller sekvensering som är unik för den växten, och genom att få kartor över enskilda växtarter upptäcker forskare liknande och varierande egenskaper som kan bidra till hälsa eller försämring av en viss växtyp. Genom att analysera kontigsegment och sekvenser i sjukdomar som bär organismer kan läkare bestämma egenskaper som sedan kan användas i behandlingsutvecklingen. Kartläggning ger visuell inblick i möjliga genetiska manipulationer genom sekvensavdelningar eller kloning.
Forskare kan odla klonade DNA -prover i bakteriell konstgjord kromosom, jäst konstgjord kromosom eller i P1 eller fag konstgjorda kromosommedier. Dessa kromosomer innehåller var som helst från 50 till hundratusentals baser, som sammanställer contig -segment. Efter en koloniseringsperiod extraheras prover med användning av en spruta och placeras i DNA -sekvenseringsgel, som genomgår elektrofores och torkar. En autoradiograf läserprov och fingeravtryck sekvenserna. Forskare skannar sedan fingeravtrycket i en bildfil, som senare kan laddas in i ett kontigprogram.