Wat is een leeskader?

Een leeskader is een reeks genetische informatie die gegevens bevat die kunnen worden gebruikt om aminozuren te coderen die in polypeptideketens kunnen worden samengevoegd om eiwitten te vormen. Leesframes zijn te vinden in zowel DNA als RNA. Onderzoekers kunnen leeskaders bestuderen om meer te weten te komen over specifieke genen en over de processen die de genexpressie kunnen verstoren.

In het geval van DNA bevat DNA sets van nucleotiden die bekend staan ​​als tripletten of codons. Elk codon kan door RNA worden getranscribeerd in een ander triplet en op zijn beurt worden omgezet in een aminozuur. Dit systeem wordt door elk levend organisme op aarde gebruikt om genetische informatie te coderen. Het genoom van het organisme, de complete verzameling genetische informatie die het bevat, bevat instructies voor alles, van het aantal ledematen om in utero te groeien, in het geval van zoogdieren, tot blauwdrukken die kunnen worden gebruikt om cellen te vervangen als ze sterven.

Het leeskader is het gedeelte van DNA of RNA dat aanwijzingen bevat voor het maken van een compleet eiwit. In DNA zijn er zes potentiële leesframes, omdat het begin van een leesframe afhangt van waar men begint te lezen en DNA dubbelstrengig is. Met RNA zijn er drie potentiële leesframes. Het is belangrijk om het juiste startpunt te identificeren, anders zal het leeskader transcriberen en vertalen als wartaal. Door naar een leeskader te kijken, kan een onderzoeker zien welk eiwit wordt verondersteld te worden gecodeerd door de groep codons.

Zoals je je kunt voorstellen, is het invoegen of verwijderen van codons een probleem. Net zoals iemand in de war raakt bij het lezen van een boek met een pagina eruit getrokken of een willekeurige alinea ingevoegd, raakt de uitdrukking van genetische informatie verward wanneer een leeskader wordt gewijzigd. Als gevolg hiervan kan een gen zich niet zoals verwacht uitdrukken en kunnen mensen aangeboren afwijkingen ontwikkelen. Dit is een manier waarop mensen genetische afwijkingen kunnen ervaren.

In een open leeskader kunnen duidelijke start- en stopcodons worden geïdentificeerd. Een open leeskader kan een compleet gen of overlappende genen bevatten; de genetische code is niet altijd zo netjes als men zou denken. In feite bevat de genetische code veel van wat bekend staat als niet-coderend DNA, wat betekent dat het DNA geen functie lijkt te hebben in termen van genexpressie. Niet-coderend DNA kan interessante informatie bevatten over de genetische erfenis van een soort en kan andere functies vervullen die na verloop van tijd zullen worden ontdekt naarmate onderzoekers meer over het genoom leren.