Wat is DNA-neerslag?
Neerslag met desoxyribonucleïnezuur (DNA) is een belangrijke stap in de isolatie en zuivering van genetisch materiaal in de wetenschap. Over het algemeen bevat een monster biologisch weefsel DNA of RNA samen met de rest van het organisme. Om het DNA te testen, moet een wetenschapper het DNA van alle andere stoffen scheiden. DNA-neerslag verwijst specifiek naar een stap waarbij het opgeloste DNA wordt gescheiden van de vloeistof waarin het is opgelost. Gebruikelijke methoden voor DNA-neerslag omvatten toevoeging van ethanol, ispropanol of glycogeen aan de vloeistof, waardoor het DNA in klonten stolt en naar de bodem van het vloeistofmonster.
De eerste stappen in de zuivering van DNA uit een monster kunnen zo eenvoudig zijn als bladeren in een kom verpletteren om een deel van de structuur af te breken. Vervolgens kan de puree worden afgebroken met chemicaliën of enzymen die het DNA intact laten. Gewoonlijk gebruiken genetici een centrifuge om verschillende componenten van een monster te splitsen. Dit is een machine die een monster laat draaien zodat het zwaarste onderdeel naar de bodem zinkt en het lichtste naar boven.
Door verschillende ongewenste componenten te verwijderen, blijft de geneticus meestal achter met een heldere vloeistof die het genetische materiaal bevat. Hij of zij moet dan het in die vloeistof opgeloste DNA verwijderen en de vloeistof en de andere stoffen in de vloeistof weggooien. DNA-neerslag is de manier waarop dit wordt bereikt. Meestal moet de wetenschapper een chemische stof toevoegen aan de vloeistof om DNA-neerslag uit te voeren.
Ethanol of isopropanol, beide vormen van alcohol en vallen in de groep oplosmiddelen van chemicaliën, zijn de meest voorkomende chemicaliën die worden gebruikt voor DNA-neerslag. Glycogeen is een andere stof die DNA kan neerslaan, maar het wordt minder vaak gebruikt, afgezien van het neerslaan van lage concentraties genetisch materiaal. Wanneer deze chemicaliën zich mengen met opgelost DNA, kunnen ze door hun chemie de manier veranderen waarop DNA in zijn omgeving past. Terwijl voorheen het DNA gemakkelijk met de vloeistof mengde, stopt het na de chemische toevoeging met de vloeistof en vormt in plaats daarvan een vaste stof.
Deze vaste stof is normaal witachtig en groepeert samen. Omdat een deel van de vaste stof nog steeds in kleine deeltjes zit, plaatst de wetenschapper het monster meestal in een centrifuge om alle vaste stoffen samen in een pellet op de bodem van de monsterbuis te spinnen. Dit is de gezuiverde vorm van het DNA dat oorspronkelijk in het monster aanwezig was en dat nuttig is voor het testen. In het algemeen wordt de vloeistof waarin de korrel is gesuspendeerd uit de buis verwijderd en kan de korrel ook worden gedroogd om de chemicaliën te laten verdampen, om de korrel zo zuiver mogelijk te maken.