Hvad er DNA-præcipitation?
Deoxyribonukleinsyre (DNA) -udfældning er et vigtigt trin i isolering og oprensning af genetisk materiale i videnskaben. Generelt indeholder en prøve af biologisk væv DNA eller RNA sammen med resten af organismekroppen. For at teste DNA'et skal en videnskabsmand adskille DNA'et fra alle de andre stoffer. DNA-præcipitation refererer specifikt til et trin, der involverer adskillelse af opløst DNA fra væsken, det opløses i. Almindelige metoder til DNA-præcipitation inkluderer tilsætning af ethanol, ispropanol eller glycogen til væsken, hvilket får DNA'et til at størkne i klumper og falde til bunden af væskeprøven.
De indledende trin i oprensningen af DNA fra en prøve kan være så enkle som at knuse blade i en skål for at nedbryde noget af strukturen. Derefter kan mosen nedbrydes med kemikalier eller enzymer, der lader DNA'et være intakt. Almindeligvis bruger genetikere en centrifuge til at hjælpe med at opdele forskellige komponenter i en prøve. Dette er en maskine, der spinder en prøve, så den tyngste komponent synker i bunden, og den lyseste stiger til toppen.
Ved at fjerne forskellige uønskede komponenter efterlades genetikeren ofte med en klar væske, der indeholder det genetiske materiale. Han eller hun skal derefter tage DNA'et, der er opløst i denne væske, og kaste væsken og de andre stoffer i væsken. DNA-udfældning er den måde, hvorpå dette opnås. Oftest har forskeren brug for at tilføje et kemikalie til væsken for at udføre DNA-udfældning.
Ethanol eller isopropanol, som begge er former for alkohol og falder ind i opløsningsmiddelgruppen af kemikalier, er de mest almindelige kemikalier, der bruges til DNA-udfældning. Glykogen er et andet stof, der kan udfælde DNA, men det er mindre almindeligt anvendt bortset fra at udfælde lave koncentrationer af genetisk materiale. Når disse kemikalier blandes med opløst DNA, giver deres kemi dem mulighed for at ændre, hvordan DNA passer ind i dets miljø. Mens DNA tidligere blandes let med væsken, efter den kemiske tilsætning, stopper det med at binde med væsken og i stedet dannes til et fast stof.
Dette faste stof er normalt hvidligt og klumper sig sammen. Da noget af det faste stof stadig er i små partikler, placerer forskeren imidlertid normalt prøven i en centrifuge for at spinde alle faste stoffer sammen til en pellet i bunden af prøverøret. Dette er den oprensede form af DNA, der oprindeligt var til stede i prøven, og som er nyttig til test. Generelt fjernes væsken, som pelleten ophænges i, fra røret, og pelleten kan også tørres for at lade kemikalierne fordampe for at gøre pelleten så ren som muligt.