Co je srážení DNA?
Srážení kyseliny deoxyribonukleové (DNA) je klíčovým krokem v izolaci a čištění genetického materiálu ve vědě. Obecně vzorek biologické tkáně obsahuje DNA nebo RNA spolu se zbytkem těla organismu. Abychom mohli testovat DNA, musí vědec oddělit DNA od všech ostatních látek. Srážení DNA se vztahuje konkrétně na krok, který zahrnuje separaci rozpuštěné DNA od kapaliny, ve které je rozpuštěna. Mezi běžné způsoby srážení DNA patří přidání ethanolu, ispropanolu nebo glykogenu do kapaliny, což způsobí, že DNA ztuhne v kusech a spadne do dno kapalného vzorku.
Počáteční kroky při čištění DNA ze vzorku mohou být stejně jednoduché jako rozdrcení listů v misce, aby se rozložila část struktury. Poté lze rmut rozložit pomocí chemikálií nebo enzymů, které zanechávají DNA neporušenou. Obecně genetici používají odstředivku, aby pomohli rozdělit různé složky vzorku. Toto je stroj, který točí vzorek tak, že nejtěžší součást klesá na dno a nejlehčí stoupá na vrchol.
Odstraněním různých nežádoucích složek je genetik obvykle ponechán v čiré kapalině, která obsahuje genetický materiál. Potom musí vyjmout DNA rozpuštěnou v této tekutině a kapalinu a další látky v ní zlikvidovat. Srážení DNA je způsob, jak toho je dosaženo. Vědec nejčastěji potřebuje přidat kapalinu do kapaliny a provést srážení DNA.
Ethanol nebo isopropanol, které jsou oběma formami alkoholu a patří do skupiny chemikálií v rozpouštědlech, jsou nejčastějšími chemikáliemi používanými pro vysrážení DNA. Glykogen je další látka, která může srážet DNA, ale je méně běžně používána, kromě srážení nízkých koncentrací genetického materiálu. Když se tyto chemikálie smíchají s rozpuštěnou DNA, jejich chemie jim umožní změnit způsob, jakým DNA zapadá do svého prostředí. Zatímco předtím se DNA snadno smísila s kapalinou, po chemickém přidání se zastavila vazba s kapalinou a místo toho se vytvořila v pevnou látku.
Tato pevná látka je obvykle bělavá a shluky dohromady. Jelikož část pevné látky je stále v malých částicích, vědec obvykle umisťuje vzorek do odstředivky, aby všechny pevné částice spolu rozpadl do pelety na dně zkumavky se vzorkem. Toto je čištěná forma DNA původně přítomné ve vzorku, což je užitečné pro testování. Obecně je kapalina, ve které je peleta suspendována, odstraněna z tuby a peleta může být také sušena, aby se umožnilo odpařování chemikálií, aby se peleta stala co možná nejčistší.