Hva er DNA-utfelling?
Deoxyribonucleic acid (DNA) -nedbør er et viktig skritt i isolering og rensing av genetisk materiale i vitenskapen. Generelt inneholder en prøve av biologisk vev DNA eller RNA sammen med resten av organismen kroppen. For å teste DNA, må en forsker skille ut DNA fra alle de andre stoffene. DNA-presipitering refererer spesifikt til et trinn som involverer separasjon av oppløst DNA fra væsken den er oppløst i. Vanlige metoder for DNA-presipitering inkluderer tilsetning av etanol, ispropanol eller glykogen til væsken, noe som får DNA til å stivne i klumper og falle til bunnen av væskeprøven.
De første trinnene i rensingen av DNA fra en prøve kan være så enkle som å knuse blader i en skål for å bryte ned noe av strukturen. Da kan potten bli brutt ned med kjemikalier eller enzymer som lar DNAet være intakt. Vanligvis bruker genetikere en sentrifuge for å dele opp forskjellige komponenter i en prøve. Dette er en maskin som snurrer en prøve slik at den tyngste komponenten synker i bunnen, og den letteste stiger til toppen.
Ved å fjerne forskjellige uønskede komponenter, sitter genetikeren ofte med en klar væske som inneholder arvestoffet. Han eller hun trenger deretter å ta ut DNA oppløst i den væsken, og kaste væsken og de andre stoffene i væsken. DNA-utfelling er måten dette oppnås. Oftest må forskeren legge til et kjemikalie til væsken for å utføre DNA-utfelling.
Etanol eller isopropanol, som begge er alkoholformer og faller inn i løsemiddelgruppen av kjemikalier, er de vanligste kjemikaliene som brukes til DNA-utfelling. Glykogen er et annet stoff som kan utfelle DNA, men det er mindre ofte brukt, bortsett fra å utfelle lave konsentrasjoner av genetisk materiale. Når disse kjemikaliene blandes med oppløst DNA, lar kjemien dem endre måten DNA passer inn i miljøet på. Mens tidligere blandet DNA lett med væsken, etter den kjemiske tilsetningen, slutter det å binde seg med væsken og i stedet dannes til et fast stoff.
Dette faste stoffet er vanligvis hvitaktig og klumper seg sammen. Ettersom noe av det faste stoffet fremdeles er i små partikler, plasserer imidlertid forskeren prøven i en sentrifuge for å spinne alle faste stoffer sammen til en pellets i bunnen av prøverøret. Dette er den rensede formen av DNA som opprinnelig var tilstede i prøven, og som er nyttig for testing. Generelt fjernes væsken som pelleten blir suspendert i, fra røret, og pelleten kan også tørkes for å la kjemikaliene fordampe for å gjøre pelleten så ren som mulig.