Co to jest masa cząsteczkowa peptydu?

Masa cząsteczkowa peptydu to liczba bez jednostek, która wynika ze stosunku średniej masy cząsteczki peptydu podzielonej przez jedną dwunastą masy atomu węgla 12. Masę cząsteczkową peptydu można również opisać jako jeden mol peptydu w gramach, jako mol to ilość peptydu równa jego masie cząsteczkowej. Dlatego, ponieważ na przykład masa aminokwasowa proliny wynosi 97,12, jeden mol proliny jest równy 97,12 gramów substancji.

Ważne jest, aby znać liczby mas cząsteczkowych peptydów w procesach takich jak synteza peptydów, ponieważ ciężar można wykorzystać do określenia stężenia składników molekularnych. Na przykład, jeśli jeden składnik miał masę cząsteczkową 50, a inny miał masę cząsteczkową 100, wówczas cząsteczki w drugim związku ważyłyby dwa razy więcej niż cząsteczki w pierwszym związku. Gdyby oba były połączone w równych gramach, związek o niższej masie miałby dwa razy więcej cząsteczek obecnych w mieszaninie, ponieważ ważyłyby tylko o połowę mniej, a zamiast stężenia 50/50 stężenie wynosiłoby około 66 / 33.

Oprogramowanie do analizowania masy cząsteczkowej jest często używane do obliczania liczb masy cząsteczkowej peptydu, ponieważ obliczenia mogą być skomplikowane inaczej. Istnieją nie tylko różne masy cząsteczkowe pierwiastków chemicznych, które należy uwzględnić w sekwencjach aminokwasowych tworzących peptydy, ale istnieją również inne czynniki, które należy wziąć pod uwagę. W grę wchodzą zarówno właściwości hydrofobowe, jak i hydrofilowe w stosunku do wody, a także molowe współczynniki absorpcji dla samych białek. Liczbę Avogadro, która reprezentuje liczbę cząsteczek w molu, należy również stosować przy określaniu objętości peptydu na podstawie masy cząsteczkowej peptydu.

Aminokwasy są budulcem peptydów. Wynoszą one od resztkowej masy cząsteczkowej, która jest rzeczywistą masą minus woda, 57,05 dla najmniejszej cząsteczki glicyny, aż do 156,19 dla największej cząsteczki, argininy. Gdy połączone są dwa lub więcej aminokwasów, do ustalenia nowej masy cząsteczkowej często stosuje się kalkulator peptydowej masy cząsteczkowej.

Określenie dokładnej masy cząsteczkowej peptydu ma ważne zastosowania w wielu badaniach. Dowody wskazują na przykład, że peptydy o niskiej masie cząsteczkowej są ważnymi regulatorami w biologii. Hormony zawierające te peptydy są aktywne w obszarach ciała, takich jak mózg, układ nerwowy i przewód pokarmowy.