O que é a montagem do genoma?

A montagem do genoma refere -se ao processo de tomar muitos pequenos pedaços de sequência genética e fundi -los em um todo coerente que representa todo o genoma de um organismo. Esse é um foco importante do campo bioinformático, e existem uma variedade de projetos de genoma para esse fim. A montagem do genoma tem sido usada para começar a analisar os genomas de muitas espécies, incluindo seres humanos, plantas, animais e bactérias. Muitos outros métodos de análise são construídos na montagem bem -sucedida e a identificação de genes não pode progredir sem ela. Mesmo antes de os genes serem encontrados, uma montagem de genoma de sucesso ainda pode gerar muitas informações úteis para análises posteriores, incluindo o tamanho do genoma, sua estrutura e sua composição geral. Quando confrontado com os FIRsAs peças do genoma, chamadas leituras cruas, raramente existem indicações em que uma peça específica vai, ou mesmo como é orientada. Cada peça é codificada de maneira semelhante com as quatro bases de DNA, abreviadas A, C, G e T. O genoma pode ser compactado em um cromossomo grande ou dividido em muitos. Também não há garantia de que algumas das leituras cruas não sejam duplicatas da mesma área do genoma, o que significaria que existem informações menos únicas do que parece à primeira vista.

O conhecimento geral da estrutura do genoma é inestimável ao iniciar o processo de montagem. Embora os genomas entre as espécies sejam marcadamente diferentes, existem certas regras que os tipos específicos de genoma seguem, e estes podem ser aplicados ao colocar outro genoma desse mesmo tipo. Por exemplo, se um certo tipo de organismo sempre tem um padrão específico próximo onde os genes são encontrados, pode -se razoavelmente assumir, ao montarOutro organismo semelhante a ele, que encontrar esse padrão sinalizaria um gene próximo. Em uma escala maior, muitos genomas bacterianos têm um cromossomo circular, por isso seria razoável antecipar que todas as leituras brutas de uma nova bactéria de alguma forma se encaixariam em um cromossomo. A aplicação de conhecimento genético geral dessa maneira pode permitir que um pesquisador comece a entender potencialmente centenas de milhares de dados.

Existem muitos outros métodos que podem ser usados ​​na montagem do genoma, incluindo previsões computacionais e comparações manuais. Independentemente do método, a montagem do genoma é um grande trabalho que muitas vezes consome tempo e difícil. Como é a base para muitas análises genéticas futuras em um organismo, há pouco espaço para erro.