Co je to polypeptid?
Proteiny jsou tvořeny stavebními bloky zvanými aminokyseliny. Když se dvě nebo více aminokyselin spojí v řetězci, lze je nazvat polypeptidem. Každá vazba mezi aminokyselinami, kde energetická přitažlivost drží bloky pohromadě, je peptidová vazba. Polypeptidy vykonávají v těle mnoho funkcí.
Aminokyseliny jsou malé molekuly, které jsou základními stavebními kameny v biologii. Mnoho biologických funkcí závisí na působení proteinu nebo polypeptidu. Obecně se velmi krátké polypeptidy obvykle nazývají peptidy a velmi dlouhé peptidy s více než asi 100 aminokyselinami se nazývají proteiny. Všechny proteiny spadají do polypeptidové skupiny, ale některé polypeptidy nesplňují kritéria pro protein.
Peptidová část názvu pochází z typu vazby mezi dvěma stavebními bloky aminokyselin. Každá aminokyselina má jeden konec nazývaný alfa-karboxylová skupina a druhý konec nazývaný alfa-aminoskupina. Tyto dvě skupiny mají odlišné chemické vlastnosti.
Alfa-karboxylová skupina má tendenci se navazovat na alfa-aminoskupinu a naopak. Jedna aminokyselina má proto tendenci se určitým způsobem navázat na jinou aminokyselinu, jako by se jedna osoba držela za ruce s jinou osobou. Jeden používá jeho pravou ruku a druhý používá její levou ruku k dokončení pouta. Tato forma vazby je peptidová vazba, a když se obě molekuly spojí dohromady, vytvoří jednu molekulu.
Spojení dvou aminokyselin vyžaduje energii. Tělo poskytuje tuto energii, když potřebuje vyrobit nové polypeptidy pro biologické použití. Po spojení dvou aminokyselin je vazba poměrně stabilní a snadno se nerozkládá.
Polypeptidy obsahují mnoho z těchto aminokyselin přilepených k sobě v přímce, stejným způsobem jako řada lidí, kteří se mezi nimi drží za ruce. Polypeptidový řetězec má obvykle také řetězce, které se v určitých bodech lepí na stranu. Jeden polypeptid může obsahovat až 2 000 jednotlivých aminokyselin.
V těle mohou polypeptidy vykonávat funkce tak, jak jsou. Mohou se také potřebovat spojit s jiným, aby vytvořili nový protein s biologickou funkcí. Někdy je jeden polypeptid vytvořen jako produkt velké buňky a poté buňka použije enzym k jeho sekání na funkční části.
Polypeptidy se poprvé vyrábějí, když buňka přečte své genetické pokyny a převede tuto informaci do sekvence aminokyselin. Každý gen kóduje konkrétní produkt a potřebné aminokyseliny jsou shromažďovány a slepeny dohromady ve správném pořadí. Sekvence je nezbytná pro správnou funkci polypeptidu, protože jinak nemůže správně interagovat se svými cíli.