Hvad er et polypeptid?
Proteiner består af byggesten, der kaldes aminosyrer. Når to eller flere aminosyrer klæber sammen i en kæde, kan de kaldes et polypeptid. Hver forbindelse mellem aminosyrerne, hvor energiattraktion holder blokke sammen, er en peptidbinding. Polypeptider udfører mange funktioner i kroppen.
Aminosyrer er små molekyler, der er essentielle byggesten i biologien. Mange biologiske funktioner er afhængige af virkningen af et protein eller polypeptid. Generelt kaldes meget korte polypeptider normalt peptider, og meget lange, med mere end ca. 100 aminosyrer, kaldes proteiner. Alle proteiner falder ind i polypeptidgruppen, men nogle polypeptider passer ikke til kriterierne for at være et protein.
Peptiddelen af navnet stammer fra typen af binding mellem to aminosyre-byggesten. Hver aminosyre har den ene ende kaldet en alfa-carboxylgruppe og en anden ende kaldet en alfa-aminogruppe. Disse to grupper har forskellige kemiske egenskaber.
En alfa-carboxyl har en tendens til at binde til en alpha-amino og vice versa. En enkelt aminosyre har derfor en tendens til at blive bundet til en anden aminosyre på en bestemt måde, ligesom en person, der holder hænder med en anden person. Den ene bruger sin højre hånd og den anden bruger hendes venstre hånd for at fuldføre båndet. Denne form for binding er en peptidbinding, og når de to molekyler klæber sammen, producerer de et molekyle.
At hænge sammen to aminosyrer kræver energi. Kroppen leverer denne energi, når den er nødt til at fremstille nye polypeptider til biologisk brug. Når de to aminosyrer er sat sammen, er bindingen ret stabil og bryder ikke let ned.
Polypeptider indeholder mange af disse aminosyrer, der sidder sammen i en lige linje på samme måde som en række mennesker, der holder hænderne imellem. En polypeptidkæde har typisk også kæder, der klæber af til siden på bestemte punkter. Et polypeptid kan indeholde så mange som 2.000 individuelle aminosyrer.
I kroppen kan polypeptider udføre funktioner, som de er. De kan også være nødt til at slå sig sammen med et andet for at danne et nyt protein med en biologisk funktion. Undertiden oprettes et enkelt polypeptid som et stort celleprodukt, og derefter bruger cellen et enzym til at hugge det op til funktionelle dele.
Polypeptider fremstilles først, når en celle læser dens genetiske instruktioner og oversætter denne information til sekvensen af aminosyrer. Hvert gen koder for et bestemt produkt, og de nødvendige aminosyrer opsamles og sidder sammen i den rigtige rækkefølge. Sekvensen er vigtig for, at polypeptidet fungerer korrekt, da det ellers ikke kan interagere korrekt med dets mål.