Co je celková izolace RNA?
Celková izolace ribonukleové kyseliny (RNA) je laboratorní technika používaná k extrahování celé buněčné RNA ze vzorku tkáně. To se liší od jiných metod zpracování, které selektivně vytahují určité typy RNA. Výzkumník by například mohl chtít zkontrolovat Messenger RNA (mRNA) a mohl by pracovat se vzorkem na extrakci pouze tohoto genetického materiálu. Pro celkovou izolaci RNA je k dispozici řada laboratorních protokolů pomocí řady produktů vyrobených vědeckými dodavateli. Může přinést čistější a použitelnější informace. Tato technika může také umožnit vědcům kontrolovat degradaci, která by mohla způsobit problémy s experimenty. Pokud má vzorek nekvalitní, může výzkumný pracovník znovu extrahovat RNA, aby získal čistší a užitečnější sbírku RNA. To může být důležité pro mnoho typů výzkumu, kde špatná RNA na začátku způsobuje problémy s experimenty po linii.
Techniky pro celkovou izolaci RNA mohou zahrnovat řadu chemických látek. Někteří se zaměřují na použití netoxických chemikálií ke snížení rizika poškození vzorku. Takové chemikálie také omezují navazující znečištění RNA a jsou bezpečnější pro pracovníky laboratoře. Laboratoře mají tendenci vybírat konkrétní chemický a protokol, který doporučuje všem personálu, a v jejich příručkách obsahují podrobný popis celkového postupu izolace RNA. Tím je zajištěno konzistence při zpracování RNA v zařízení, aby se dosáhlo stabilnějších a užitečnějších výsledků.
Proces začíná přípravou vzorku tkáně, který se může lišit velikostí, aby byl připraven na ošetření, která chemická činidla k nakreslení celkové RNA. Technici konzultují laboratorní příručku, aby určili, jak zpracovat vzorek a ošetřit jej, aby izoloval RNA. Mohou použít nástroje, jako jsou elektroforézní destičky ke kontrole kvality vzorku a hledat známky degradatuion, který by mohl naznačovat problém s celkovým procesem izolace RNA.
Vědci mohou provádět vlastní izolaci RNA nebo delegovat tento úkol na laboratorního asistenta, postgraduálního studenta nebo podobného laboratorního pracovníka. Je také možné uzavřít smlouvu o izolaci do jiných laboratorních zařízení. To může být někdy nutné k ochraně integrity experimentu pomocí třetí strany k vytvoření ověřitelných a opakovatelných výsledků. V jakýchkoli vědeckých článcích založených na výzkumu s izolovanou RNA musí výzkumný pracovník diskutovat o metodě použité pro izolaci a kdo provedl práci.