Co je celková izolace RNA?
Celková izolace ribonukleové kyseliny (RNA) je laboratorní technika používaná k extrahování veškeré buněčné RNA ze vzorku tkáně. To se liší od jiných metod zpracování, které selektivně vytáhnou určité typy RNA. Vědec by například mohl chtít prozkoumat messengerovou RNA (mRNA) a mohl se vzorkem extrahovat právě tento genetický materiál. Existuje celá řada laboratorních protokolů pro celkovou izolaci RNA pomocí různých produktů vyráběných vědeckými dodavateli.
Shromažďování veškeré buněčné RNA ze vzorku tkáně může mít řadu výhod. Může přinést čistší a použitelnější informace. Tato technika může také umožnit vědcům zkontrolovat degradaci, která by mohla způsobit problémy s experimenty. Pokud je vzorek nekvalitní, může výzkumník extrahovat RNA znovu, aby získal čistší a užitečnější soubor RNA. To může být důležité pro mnoho typů výzkumu, kde špatná RNA na začátku způsobuje problémy s experimenty v řadě.
Techniky totální izolace RNA mohou zahrnovat celou řadu chemických látek. Někteří se zaměřují na použití netoxických chemikálií, aby se snížilo riziko poškození vzorku. Tyto chemikálie také omezují následné znečištění RNA a jsou pro laboratorní pracovníky bezpečnější. Laboratoře mají tendenci vybírat konkrétní chemickou látku a protokol, který doporučí všem zaměstnancům, a ve svých příručkách uvádějí podrobný popis postupu úplné izolace RNA. Tím je zajištěna konzistence ve zpracování RNA v zařízení, aby bylo dosaženo stabilnějších a užitečnějších výsledků.
Proces začíná přípravou vzorku tkáně, který se může lišit velikostí, aby byl připraven k ošetření, která chemická činidla odebírají celkovou RNA. Technici se seznámí s laboratorním manuálem a zjistí, jak se vzorkem zacházet a zacházet s ním za účelem izolace RNA. Mohou použít nástroje, jako jsou elektroforetické destičky, ke kontrole kvality vzorku a hledat známky degradace, které by mohly naznačovat problém s procesem izolace celkové RNA.
Vědci mohou provádět vlastní izolaci RNA nebo tento úkol delegovat na laboratorního asistenta, postgraduálního studenta nebo podobného laboratorního pracovníka. Je také možné uzavřít izolaci na jiná laboratorní zařízení. Někdy to může být nezbytné k ochraně integrity experimentu pomocí třetí strany k vygenerování ověřitelných a opakovatelných výsledků. V jakýchkoli vědeckých dokumentech založených na výzkumu s izolovanou RNA musí výzkumný pracovník diskutovat o metodě použité pro izolaci ao tom, kdo práci provedl.